Le Collège Autrement a un agrément pédagogique du rectorat, il est hors contrat de l’éducation nationale. A ce titre il ne peut recevoir aucune subvention du secteur publique. Tous les frais de scolarité et autres charges sont supportés par les parents d’élèves, des dons et mécénats privés et des opérations de financement participatif porté par les adhérents.